Penis består ytre anatomisk av penisskaftet og penishodet, også navngitt som glans (fig. 2). Over glans ligger forhuden, en løs hudfold som enkelt kan trekkes bak over glans. Under forhuden dannes det over tid et illeluktende belegg (smegma) bestående av cellerester, fettstoffer og fuktighet. Dette kan skape irritasjoner på penis dersom det ikke vaskes vekk regelmessig.
Indre anatomisk er penis utstyrt med de karakteristiske svamplegemene: corpora cavernosa, som det fins to av og som danner storparten av penis’ indre, og corpus spongiosum som omslutter urehtra (fig 2). Svamplegemene gjør penis i stand til å erigere samtidig som urethra holdes åpen.
Fig.2 Mannens kjønnsorgan tversnitt